Protein–RNA interactions for Protein: B1ARV6

Pramef20, PRAME family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef20B1ARV6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pramef20B1ARV6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pramef20B1ARV6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms