Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
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Atp8b5A3FIN4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Atp8b5A3FIN4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Atp8b5A3FIN4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
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Atp8b5A3FIN4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Atp8b5A3FIN4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Atp8b5A3FIN4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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