Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms