Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
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