Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms