Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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