Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms