Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms