Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms