Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSB3

Gm3880, Predicted pseudogene 3880, mousemouse

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Length 72 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3880A0A1B0GSB3 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm3880A0A1B0GSB3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm3880A0A1B0GSB3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm3880A0A1B0GSB3 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm3880A0A1B0GSB3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm3880A0A1B0GSB3 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm3880A0A1B0GSB3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm3880A0A1B0GSB3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm3880A0A1B0GSB3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm3880A0A1B0GSB3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm3880A0A1B0GSB3 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm3880A0A1B0GSB3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm3880A0A1B0GSB3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm3880A0A1B0GSB3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm3880A0A1B0GSB3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm3880A0A1B0GSB3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm3880A0A1B0GSB3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm3880A0A1B0GSB3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm3880A0A1B0GSB3 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm3880A0A1B0GSB3 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm3880A0A1B0GSB3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm3880A0A1B0GSB3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm3880A0A1B0GSB3 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm3880A0A1B0GSB3 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm3880A0A1B0GSB3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm3880A0A1B0GSB3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm3880A0A1B0GSB3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm3880A0A1B0GSB3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm3880A0A1B0GSB3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm3880A0A1B0GSB3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm3880A0A1B0GSB3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm3880A0A1B0GSB3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm3880A0A1B0GSB3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm3880A0A1B0GSB3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm3880A0A1B0GSB3 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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