Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC8.8□□□□□ -1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
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