Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms