Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms