Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms