Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms