Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms