Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin2Q9WVE8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms