Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms