Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf13bQ9WU72 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms