Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms