Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU20

Mthfr, Methylenetetrahydrofolate reductase, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MthfrQ9WU20 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MthfrQ9WU20 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MthfrQ9WU20 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MthfrQ9WU20 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MthfrQ9WU20 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MthfrQ9WU20 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MthfrQ9WU20 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MthfrQ9WU20 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MthfrQ9WU20 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MthfrQ9WU20 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MthfrQ9WU20 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MthfrQ9WU20 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MthfrQ9WU20 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MthfrQ9WU20 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MthfrQ9WU20 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MthfrQ9WU20 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MthfrQ9WU20 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MthfrQ9WU20 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MthfrQ9WU20 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MthfrQ9WU20 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MthfrQ9WU20 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MthfrQ9WU20 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MthfrQ9WU20 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MthfrQ9WU20 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MthfrQ9WU20 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MthfrQ9WU20 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MthfrQ9WU20 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MthfrQ9WU20 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MthfrQ9WU20 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MthfrQ9WU20 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MthfrQ9WU20 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MthfrQ9WU20 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MthfrQ9WU20 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MthfrQ9WU20 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms