Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1T4

Sept6, Septin-6, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept6Q9R1T4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept6Q9R1T4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept6Q9R1T4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept6Q9R1T4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept6Q9R1T4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept6Q9R1T4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept6Q9R1T4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept6Q9R1T4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept6Q9R1T4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept6Q9R1T4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept6Q9R1T4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept6Q9R1T4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept6Q9R1T4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept6Q9R1T4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept6Q9R1T4 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept6Q9R1T4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept6Q9R1T4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept6Q9R1T4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept6Q9R1T4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept6Q9R1T4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept6Q9R1T4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Sept6Q9R1T4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sept6Q9R1T4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sept6Q9R1T4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sept6Q9R1T4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sept6Q9R1T4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sept6Q9R1T4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sept6Q9R1T4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sept6Q9R1T4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept6Q9R1T4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms