Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms