Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms