Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed2Q9R0Q3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms