Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms