Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fhl3Q9R059 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms