Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp21Q9QZL6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms