Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ripk3Q9QZL0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms