Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms