Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms