Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms