Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms