Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms