Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg2Q9QXK3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms