Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms