Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE0

Hacl1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacl1Q9QXE0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacl1Q9QXE0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms