Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms