Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms