Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms