Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms