Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms