Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cabp1Q9JLK7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms