Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nectin3Q9JLB9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nectin3Q9JLB9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nectin3Q9JLB9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms