Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL19

Ncoa6, Nuclear receptor coactivator 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa6Q9JL19 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ncoa6Q9JL19 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ncoa6Q9JL19 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ncoa6Q9JL19 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ncoa6Q9JL19 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ncoa6Q9JL19 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ncoa6Q9JL19 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ncoa6Q9JL19 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ncoa6Q9JL19 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ncoa6Q9JL19 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ncoa6Q9JL19 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms