Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms