Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Mrpl39Q9JKF7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Mrpl39Q9JKF7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Mrpl39Q9JKF7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Mrpl39Q9JKF7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Mrpl39Q9JKF7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms