Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms