Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms