Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms